man in the middle, где man - ваш провайдер о чём собственно браузер и предупреждает
т.е. если раньше провайдер просто передавал поток, то сейчас он его читает

не web приложениям это не грозит

p.s.
"Но делать нечего, устанавливаем сертификат на компьютер, в хранилище “доверенных корневых сертификатов”" - совсем не обязательно, в ie можно просто игнорировать предупреждение %)) - влияет только на визуальность (что является предупредительной мерой)