Jan. 26th, 2019

juan_gandhi: (Default)
Пару лет назад интервьюировался в Кариус, это такая генетическая контора. Мне там подбросили задачку на дом, на спарке чтобы искать патогены в сиквенсе. Ну т.е. подстроки. Я, будучи знаком с алгоритмом Укконена, не видел смысла использовать спарк, распараллелил все в одной программе, и все дела, 10 минут, готово. Но им не понравилось.

А вот сейчас у меня два таких вопроса уже возникает:
- При чем тут нахер спарк, если нужно искать подстроку в строке;
- Каким образом патоген холеры вообще вдруг оказывается в генах человека? Это вообще что, они не ебанулись часом? Это ж лысенковщина. - Тут я неправ. Они ищут не в генах человека, а в супе из генов, который получается, если просто взять капельку крови. (Кстати, а почему оно sequence?)


Ну и заодно хотелось бы вообще понять, что у людей в головах; но я не врач.

Profile

juan_gandhi: (Default)
Juan-Carlos Gandhi

September 2025

S M T W T F S
 1 2345 6
78 9 10 111213
14 151617 181920
21222324252627
282930    

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Sep. 18th, 2025 08:38 pm
Powered by Dreamwidth Studios